Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms