Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3BP20337 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms