Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms