Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREB1P16220 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms