Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSP16219 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSP16219 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms