Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2P10911 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCF2P10911 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCF2P10911 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCF2P10911 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCF2P10911 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCF2P10911 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCF2P10911 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCF2P10911 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCF2P10911 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCF2P10911 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms