Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms