Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms