Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HLA-DQB1P01920 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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