Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTAP01040 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSTAP01040 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSTAP01040 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSTAP01040 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTAP01040 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTAP01040 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTAP01040 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTAP01040 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTAP01040 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTAP01040 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms