Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms