Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms