Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F3O00716 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F3O00716 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms