Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms