Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
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