Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms