Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms