Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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