Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms