Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms