Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RABGEF1Q9UJ41 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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