Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms