Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms