Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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