Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSD3Q9NYI0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSD3Q9NYI0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSD3Q9NYI0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSD3Q9NYI0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms