Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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HOXC10Q9NYD6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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HOXC10Q9NYD6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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HOXC10Q9NYD6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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HOXC10Q9NYD6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC10Q9NYD6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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