Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms