Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms