Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms