Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NYXQ9GZU5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NYXQ9GZU5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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