Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms