Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms