Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BCO2Q9BYV7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms