Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms