Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GORASP1Q9BQQ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GORASP1Q9BQQ3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms