Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms