Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms