Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms