Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCA3Q99758 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA3Q99758 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms