Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms