Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms