Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms