Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLMNQ96JQ2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLMNQ96JQ2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms