Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC112Q8NEF3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC112Q8NEF3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms