Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms