Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMEM61Q8N0U2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMEM61Q8N0U2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMEM61Q8N0U2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM61Q8N0U2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM61Q8N0U2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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