Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms