Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms