Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms