Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF6Q330K2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF6Q330K2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms